Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00208Q96KT6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms