Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRIQ1Q96JM4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms