Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPUSD4Q96CM3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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