Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CNOT9Q92600 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms