Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC21AQ8NDW8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms