Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF439Q8NDP4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZNF439Q8NDP4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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