Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C10orf53Q8N6V4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C10orf53Q8N6V4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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