Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP54Q7Z3B4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms