Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF550Q7Z398 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms