Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms