Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRNP1Q6NT89 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRNP1Q6NT89 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms