Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
OBSCNQ5VST9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms