Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CEP170Q5SW79 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CEP170Q5SW79 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms