Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PERM1Q5SV97 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PERM1Q5SV97 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms