Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms