Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC27A3Q5K4L6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC27A3Q5K4L6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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