Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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