Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDCA8Q53HL2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms