Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL22Q53GT1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms