Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP28Q4G0W2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms