Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF212Q495C1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF212Q495C1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms