Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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