Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms