Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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FXNQ16595 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FXNQ16595 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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