Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GRIK5Q16478 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms