Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP6AP1Q15904 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms