Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIP10Q15642 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms