Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PCM1Q15154 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PCM1Q15154 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PCM1Q15154 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCM1Q15154 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PCM1Q15154 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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