Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMC1AQ14683 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMC1AQ14683 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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