Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCARF1Q14162 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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