Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIDRQ14159 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms