Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms