Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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KCNC3Q14003 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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KCNC3Q14003 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNC3Q14003 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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