Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMB3Q13751 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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