Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CUL4AQ13619 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CUL4AQ13619 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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