Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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NAE1Q13564 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NAE1Q13564 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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