Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
HDAC1Q13547 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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