Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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