Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTGDRQ13258 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms