Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF6Q13247 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms