Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME3Q13232 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME3Q13232 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME3Q13232 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME3Q13232 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms