Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHAF1BQ13112 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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