Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms