Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM32Q13049 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms