Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK3Q13003 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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