Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BNIP3Q12983 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNIP3Q12983 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms