Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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BNIP1Q12981 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP1Q12981 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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