Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME1Q06323 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME1Q06323 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms