Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCDQ05655 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms