Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP7AQ04656 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms